Škola radi od 1843.godine kada je poduku mladeži vršio orguljaš Mihalj Šibila, rodom iz Zlatara. U školskoj Spomenici stoji:
“Ovamo je došao u najljepšoj muževnoj dobi. Taj je čovjek bio jednostavan seljak, nadilazeći druge svojom naobrazbom utoliko, što je svršio u Zlataru tadašnju pučku školu, naučio čitati, pisati i nešto računati i što je kod svakog učitelja po tadašnjoj praksi osposobio se za orguljaša i ponešto za učitelja.”
Od 1869. godine u službu učitelja stupio je Đuro Prejac, rođen u Štajerskoj 14. travnja 1847.godine. Prosvjeta i kultura ovog kraja zahvalna je ovom učitelju, te škola danas nosi njegovo ime.
Za školsku 1875./76.godinu stoji da je sposobnjaka za polazak u školu bilo 292 dječaka, 251 djevojčica – ukupno 543. Iz rečenog vidljivo je da je školu polazilo te školske godine samo 40% sposobne djece za školu.
Od 1948. godine škola u Desiniću radi kao šestogodišnja škola. Peti razred polazi 34 učenika od 60 obveznika. Od 1955. godine škola u Desiniću radi kao osmogodišnja, tj. te godine sedmi razred polazila su 23 učenika, a osmi razred po prvi put završavaju učenici u šk. 1956./57.godini dobivši “spomen svjedodžbu o završenoj osnovnoj osmogodišnjoj školi”.
Sadašnja mreža škola cjelokupnog školskog područja prostire se na matičnu školu Desinić i područne škole Veliku Horvatsku i Vinagoru.